Seit der ersten Präsentation des Projekts im Jahr 2000 sind wichtige Weichen für die Realisierung gestellt worden.

Die neuen S-Bahn-Haltestellen Salzburg Gnigl, Salzburg Parsch, Salzburg Sam, Puch Urstein, Hallein Burgfried und Kuchl Garnei sind bereits in Betrieb. Die Haltestelle in Oberalm wurde im Dezember 2006 eröffnet. Damit ist der Ausbau des Süd-Astes abgeschlossen.

Richtung Freilassing sind die Haltestellen, Salzburg Aiglhof, Salzburg Mülln-Altstadt und Salzburg Taxham Europark bereits in Betrieb. Die Bauverhandlung für die Haltestelle Salzburg Liefering hat im Oktober 2005 stattgefunden. Die Salzach Eisenbahn-Brücke ist fertiggstellt. Damit waren auch weitreichende Lärmschutzmaßnahmen verbunden.

Die Planungen für den Nord-Ast, dem dritten Streckenast des S-Bahn Systems auf der Westbahn-Strecke zwischen Salzburg und Straßwalchen, laufen bereits.